Científicos desarrollan un modelo impulsado por IA para mejorar las inmunoterapias contra el cáncer

Científicos de Ludwig Cancer Research Con el uso de IA, han desarrollado un modelo predictivo que puede identificar las células inmunitarias que matan el cáncer que tienen el mayor potencial para ser utilizadas en inmunoterapias. Esta herramienta, TRTpred, se describe especialmente, en detalle, en la prestigiosa revista Nature Biotechnology.

Personalización de los tratamientos contra el cáncer

El modelo TRTpred, respaldado por algoritmos, puede integrarse en tratamientos contra el cáncer individualizados y terapias adaptadas según la firma de las células precancerosas de cada paciente. Como mencionó el Sr. Alexander Harari de Ludwig Lausana, el investigador principal del trabajo, esta nueva técnica podría ofrecer un nuevo conjunto de subsidios a los pacientes.

Las células inmunitarias encontradas en el cáncer transferidas a un paciente, conocidas como linfocitos infiltrantes de tumores (TIL), forman la base de la inmunoterapia celular. Estos TIL luego podrían modularse opcionalmente para aumentar sus capacidades sinérgicas intrínsecas contra el cáncer y luego reintroducirse en el cuerpo después de ser escalados en cultivo. Sin embargo, no todos los TIL asisten con éxito a las células sospechosas de tumor, siendo solo una fracción reactiva al tumor.

Harari y su equipo idearon TRTpred, un enfoque de modelado predictivo impulsado por IA que les permite clasificar los receptores de células T (TCR) según su reactividad tumoral. A medida que TRTpred identifica los genes responsables de la secreción tumoral, puede crear una regla que se aplicará a una nueva población y luego predecir con precisión si un TCR es una célula reactiva al tumor o no.

TRTpred: Un cambio de juego impulsado por IA

Los científicos mejoraron la calidad del paso anterior con filtros algorítmicos con el objetivo de encontrar T-celulas portadoras de antígenos tumorales de alta avididad, es decir, aquellas capaces de una fuerte unión de antígenos. Además, se añadió un tercer filtro con el objetivo de una mejor diferenciación de antígenos para las células tumorales, lo que contribuye a la orientación de múltiples antígenos.

El equipo extrajo los TCR de los TIL y utilizó MixTRTpred (una combinación de la técnica TRTpred y filtros de los algoritmos) para identificar las células T que podrían ser útiles para atacar tumores de alta avididad y específicos para múltiples antígenos tumorales. Estas células T modificadas se introdujeron con éxito en los ratones, donde la eliminación de los tumores fue evidente cuando se completó el xeninjerto, proporcionando así la prueba del método.

George Coukos, director de Ludwig Lausana y coautor del estudio, tiene la intención de iniciar un ensayo clínico de Fase I lo antes posible en humanos para probar la tecnología. Declaró que tenía gran esperanza en el rendimiento del método, ya que creía que obligaría a superar las deficiencias actuales de las terapias basadas en TIL. Específicamente, aquellos pacientes cuyos tumores no reaccionan como se supone que deben hacerlo hoy en día.